Минералогический музей основан в 1991 г. С 2007 называется Лабораторией минералогии географического факультета. Коллекция музея состоит и экспозиционного, фондового и учебного отделов, включающих образцы минералов и горных пород. Экспозиция расположена тематическими стендами:
- Группы минералов по химической классифиции;
- Минералы и горные породы Алтая;
- Магматические горные породы;
- Осадочные горные породы;
- Метаморфические горные породы.